胚胎净化的目的是获得无特定病原体（Specific pathogen Free, SPF）动物，即体内无特定的微生物和寄生虫存在的动物。常用的方法包括剖腹产和胚胎移植，但由于剖腹产不能消除垂直传播的病毒（如鼠巨细胞病毒MCMV；淋巴细胞性脑膜炎病毒LCMV和脑胞内原虫ECUN），且对于手术设施依赖程度较大，目前通过胚胎移植的方法，消除病毒、细菌和寄生虫，是易行的品系净化方法。
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